Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mvb12bQ6KAU4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms