Protein–RNA interactions for Protein: Q6IS41

Slc25a47, Solute carrier family 25 member 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a47Q6IS41 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc25a47Q6IS41 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc25a47Q6IS41 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms