Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt39Q6IFX4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms