Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt42Q6IFX2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms