Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms