Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms