Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT9

Nomo1, Nodal modulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nomo1Q6GQT9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nomo1Q6GQT9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nomo1Q6GQT9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms