Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca2Q6DIC0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms