Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gbf1Q6DFZ1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gbf1Q6DFZ1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms