Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6DFW0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6DFW0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6DFW0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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