Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp7Q6A4J8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp7Q6A4J8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp7Q6A4J8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp7Q6A4J8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp7Q6A4J8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp7Q6A4J8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms