Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cep290Q6A078 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Cep290Q6A078 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Cep290Q6A078 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Cep290Q6A078 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cep290Q6A078 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cep290Q6A078 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cep290Q6A078 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Cep290Q6A078 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Cep290Q6A078 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Cep290Q6A078 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Cep290Q6A078 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep290Q6A078 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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