Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fgd6Q69ZL1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fgd6Q69ZL1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fgd6Q69ZL1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fgd6Q69ZL1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd6Q69ZL1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd6Q69ZL1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd6Q69ZL1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd6Q69ZL1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd6Q69ZL1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd6Q69ZL1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd6Q69ZL1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms