Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zcchc2Q69ZB8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zcchc2Q69ZB8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms