Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrcc1Q69ZB0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrcc1Q69ZB0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms