Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sbno1Q689Z5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sbno1Q689Z5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms