Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp4eQ66X19 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms