Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nlrp9cQ66X01 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms