Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms