Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ino80dQ66JY2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms