Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Knl1Q66JQ7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms