Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms