Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg1Q64343 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Abcg1Q64343 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Abcg1Q64343 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg1Q64343 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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