Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Irf4Q64287 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf4Q64287 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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