Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc18Q640L5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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