Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PatjQ63ZW7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PatjQ63ZW7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms