Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20854Q62461 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20854Q62461 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms