Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcncQ62447 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CcncQ62447 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CcncQ62447 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms