Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms