Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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