Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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