Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tff3Q62395 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Tff3Q62395 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tff3Q62395 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tff3Q62395 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tff3Q62395 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tff3Q62395 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tff3Q62395 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tff3Q62395 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tff3Q62395 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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