Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SypQ62277 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SypQ62277 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SypQ62277 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SypQ62277 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SypQ62277 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SypQ62277 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SypQ62277 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SypQ62277 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SypQ62277 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SypQ62277 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SypQ62277 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SypQ62277 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SypQ62277 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SypQ62277 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SypQ62277 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SypQ62277 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SypQ62277 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SypQ62277 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SypQ62277 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SypQ62277 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SypQ62277 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SypQ62277 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SypQ62277 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SypQ62277 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SypQ62277 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SypQ62277 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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