Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall3Q62255 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms