Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttf1Q62187 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttf1Q62187 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms