Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema3cQ62181 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms