Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema4aQ62178 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema4aQ62178 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms