Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbm38Q62176 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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