Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpc2Q62029 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms