Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itm2aQ61500 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms