Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms