Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smarcd1Q61466 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms