Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsx2Q61412 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms