Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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