Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nab1Q61122 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms