Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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