Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms