Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Scarb1Q61009 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Scarb1Q61009 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Scarb1Q61009 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Scarb1Q61009 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Scarb1Q61009 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Scarb1Q61009 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Scarb1Q61009 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scarb1Q61009 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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