Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cdkn2dQ60773 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cdkn2dQ60773 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdkn2dQ60773 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdkn2dQ60773 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cdkn2dQ60773 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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