Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Irgm1Q60766 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Irgm1Q60766 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Irgm1Q60766 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Irgm1Q60766 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Irgm1Q60766 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Irgm1Q60766 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Irgm1Q60766 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Irgm1Q60766 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Irgm1Q60766 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irgm1Q60766 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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